水族箱里誕生了4條小魚，其中包括哈羅德的女兒伊莎貝爾。伊莎貝爾的身上長著不好看的斑點還缺失了一些鱗片，她的長相遭到魚群的其他成員嘲笑。魚群首領瑟斯頓要求哈羅德必須把伊莎貝爾藏起來否則被人來發(fā)現(xiàn)將會把他們丟進大海里。貪玩的伊莎貝爾還是被人類發(fā)現(xiàn)了，她和哈羅德一起被丟進浩瀚無邊的大海里。海上突如其來的巨大風浪使得水族箱里的魚都掉進大海,一時之間，伊莎貝爾和哈羅德失散了。伊莎貝爾偶遇了艾普爾并結識了一群長相奇特的魚，它們皆因外在缺陷被同族排擠。在艾普爾的帶領下，伊莎貝爾和其它魚準備穿越火山抵達珊瑚礁尋找哈羅